Na terceira temporada, quando nos voltamos a reunir com a tripulação da Enterprise, esta enfrenta as consequências do angustiante encontro da temporada anterior com os Gorn.

Mas novas formas de vida e outras civilizações estão à espera de ser descobertas, incluindo um vilão que irá testar a coragem e a determinação do Capitão Pike e dos membros da nave espacial que comanda.